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我校国重室创建了全新的基因转录调控筛选方法
2021-06-04 00:12
本文摘要:近期,我校林学院林木遗传选育国家重点实验室在国际顶尖学术期刊Genome Research(综合类期刊1区,IF=11.638)公开发表为题“A Novel Synthetic-Genetic-ArrayBased Yeast One-Hybrid System for High Discovery Rate and Short Processing Time”的研究论文,明确提出了全新的基因mRNA调控检验方法。

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近期,我校林学院林木遗传选育国家重点实验室在国际顶尖学术期刊Genome Research(综合类期刊1区,IF=11.638)公开发表为题“A Novel Synthetic-Genetic-ArrayBased Yeast One-Hybrid System for High Discovery Rate and Short Processing Time”的研究论文,明确提出了全新的基因mRNA调控检验方法。真核生物的基因表达一般来说受到mRNA因子(transcription factor, TF)与基因启动子上DNA顺势起到元件(DNA cis-targets)相互作用的调控。酵母单杂交(Yeast one-hybrid,Y1H)是目前应用于尤为普遍的用作找到TF-DNA间互作的方法。

目前有两种广为用于的Y1H方法:一种是单倍体转化成,通过次序转化成的方式将TF和DNA依序转化成到同一颗酵母细胞中展开TF-DNA的检验,此种检验方法有较高的检验效率,但同时具备十分宽的实验周期;另外一种方法是二倍体杂交,將TF和DNA分别并转到有所不同性别的酵母细胞中,杂交产生联合包括TF和DNA的二倍体酵母细胞,此种方法具备十分较短的实验周期,但只有单倍体转化成一半的检验效率。该项研究统合了这两种传统的Y1H方法,创立了全新的有丝分裂细胞内的酵母单杂交系统,利用新的脱胎的“Y1HGold-MM strain”酵母菌株通过二倍体杂交的方式产生包括TF-DNA的二倍体酵母细胞,再行通过有丝分裂的方法,检验出有包括TF-DNA的单倍体细胞。

此方法使新的系统同时享有了单倍体转化成检验效率高和双倍体杂交实验周期短的特点。团队利用早已创建的原生质体和免疫系统共沉淀技术(Lin and Li et al., 2013,The plantCell; Lin et al., 2014,NatureProtocols; Li et al., 2014,NatureProtocols)对三种Y1H方法的体内发生率展开检验,证明了有丝分裂细胞内的Y1H系统具备最低体内发生率。

研究突破了长久以来Y1H系统不存在的检验效率和实验周期无法顾及的难题,创立了全新的酵母单杂交系统,为大型遗传调控网络的创建奠下了最重要的实验基础。国家重点实验室在读博士研究生王志凤和台湾中研院叶仲书博士为论文的联合第一作者,林盈仲教授、张典贞教授、李伟教授和姜立泉教授为联合通讯作者。

重点实验室的曲冠证教授、刘桂丰教授、姜静教授、王鹏宇教授也参予了此论文公开发表。


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